×

バイオインフォマティクス

Big Data to Knowledge with MKI

生命情報とITで人と地球を幸せに

 1975年、当社の前身である三井情報開発(株)は「人工酵素による化学合成システムの研究開発」に取り組みました。以来、40余年にわたり、当社は先進的な情報技術をバイオサイエンスに応用することに力を注いでいます。

近年では、次世代シーケンサーの登場によりゲノム塩基配列の解読技術に革命的な進歩がもたらされ、大量なゲノム配列が入手可能になりました。加えて、遺伝子発現やタンパク質の構造解析法、多様な生体分子の高速な分離技術が開発され、ハイスループットな測定データも著しく増加しています。そのため、従来の解析手法や高機能計算機でも処理が困難なこれらビッグデータの解析技術が今求められています。

 私たちは、これまで培ってきた豊富な経験と実績を元に、お客様のビッグデータから新しい『知識』を創造します。

Categories

 

  • Genomics
    全ゲノム関連解析、全ゲノム解析、 SNP解析、エキソーム解析、CGH解析、エピゲノム解析
    ■次世代シーケンス解析サービス
  • Transcriptomics
    遺伝子発現解析、RNA-Seq解析、転写因子結合部位解析 
  • Proteomics 
    タンパク質発現解析、リン酸化解析、翻訳後修飾解析
    ■多検体サンプル解析&マーカー探索『2DICAL』
    ■プロテオーム解析プラットフォーム『Xome』
  • Metabolomics 
    生体内脂質プロファイル解析、代謝パスウェイ解析
    ■ハイスループット脂質同定システム『LipidSearch』
    ■代謝経路解析システム『CrossPath』
    ■糖鎖微量迅速解析システム用検索ソフト
  • Systems Biology 
    ネットワーク解析、パスウェイ解析
    代謝フラックス解析、生体シミュレーション
    バイオプロセスデザイン
  • Structural Informatics 
    アミノ酸配列/タンパク質構造解析、分子動力学シミュレーション
    タンパク質立体構造予測、ドッキングシミュレーション
  • Chemoinformatics 
    リード化合物探索、バーチャル化合物スクリーニング
  • Data Management 
    大規模データベース構築、セマンティックWeb
    全文検索、データマイニング、グラフマイニング
    HPCI、クラウドコンピューティング、インメモリコンピューティング

※■は当社プロダクト・サービスです。

Applications

  • Biomarker Discovery
    バイオマーカーは、疾患の発症や進行を診断するために用いられる指標です。また、それ自身が創薬ターゲットとしても医薬品開発に応用される可能性を持っています。MKIでは、ゲノミクス、プロテオミクスを含むマルチオミクスなアプローチから候補分子を探索します。
  • Drug / Target Discovery
    バイオ医薬品は従来の低分子医薬品に比べ、標的特異性が高く副作用も少ないとされ注目されています。しかし、バイオ医薬品は生体物質から誘導されるため、その構造は複雑で、特定の標的に対する医薬品の開発は非常に困難です。 MKIでは、タンパク質立体構造予測や分子モデリングに関する専門家が、最新の技術を用いてお客様の課題を解決します。
  • Personalized Medicine
    ゲノム解析を中心とした個別化医療の開発により、個々の患者ごとに最適な医療を実践することが可能となり、病気からの早期回復や医療費の節減が期待されています。MKIでは、長年培ってきたバイオインフォマティクス分野の経験とITを組み合わせ、医療従事者や研究者と共に個別化医療の実現を支援します。

※記載されている社名・商品名は、各社の商標または登録商標です。

最新情報

2018/07/10 弊社社員共著による論文がEpigenomicsに掲載されました
2018/07/03 MKIナレッジに『目盛りってなんだろう』が掲載されました
2018/05/25 MKIナレッジに『母と子の不思議なつながり』が掲載されました
2017/06/19 MKI、理研ジェネシスと協業し、国内検査施設を活用した遺伝子解析サービス「OncoPrime Basic」を7月から提供開始
2017/06/05 MKI、シスメックスおよび理研ジェネシスとゲノム医療における包括的な業務提携を開始
2017/03/02 MKI、がん遺伝子解析サービス「OncoPrime」を関東初となる千葉大学病院に提供
2016/09/27 SAP社とペンシルバニア大学 ウオートン校共同で作成したホワイトペーパーに、MKIのゲノム解析事例が引用されました
2016/08/18 日経バイオテク 8月8日号特集「癌クリニカルシーケンス」に「OncoPrime」の情報が掲載されました
2015/10/01 【10/29-31京都開催】 生命医薬情報学連合大会 2015年大会(日本バイオインフォマティクス学会 2015年年会)ランチョンセミナー講演/ブース出展のご案内
2015/06/19 【7/29(水)大阪、7/31(金)東京開催】 サーモフィッシャー質量分析計ユーザーズフォーラム出展のご案内
2015/06/19 【7/3(金) 開催】 かずさDNA研究所「2015食品開発セミナー」講演のご案内
2015/06/10 【6/17(水)~19(金) 開催】 第63回質量分析統合討論会にて弊社ソフトウェア『Lipid Serch』に関するポスター発表及び、ブース展示を行います。 
2015/05/15 【6/11(木) 開催】 第364回CBI学会講演会「タンパク質立体構造予測とタンパク質デザイン」講演のご案内
2015/05/15 【5/30(土) 開催】 バイオグリッド研究会2015~スパコンが切り拓く創薬・医療の新時代~講演のご案内
2015/05/11 【5/13(水) 開催】 サーモフィッシャー機器分析ユーザーズフォーラムにて弊社ソフトウェア『Lipid Serch』に関するポスター発表を行います。
2015/04/01 4月1日付けの組織変更に伴い、当部署名が変更になりました。
これまでのバイオ基礎研究分野から創薬研究分野向けのコンサル及びシステム構築に加えて、最新の技術を駆使したビッグデータ解析や個別化医療向けのICTサービス等にも取り組んで参ります。引き続き宜しくお願い申し上げます。

【変更前】
事業開発部 バイオサイエンス室

【変更後】
IT基盤サービス事業本部 クラウドサービス部 バイオメディカル室
電話番号:03-6376-1291(※電話番号及びFAX番号に変更はありません。)
2015/03/09 MKI、がん遺伝子を解析し、個々の患者に最適な治療薬候補等の情報を医師に提供する「OncoPrime」を提供開始
2014/12/03 学会発表・投稿論文リストを更新致しました。
2014/11/25 弊社社員共著による論文がBioinformaticsに掲載されました。
2014/11/04 【11/12(水) 開催】サーモフィッシャー秋の食品セミナー出展のご案内別
2014/09/19 【10/2(木)~4(土) 開催】第3回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2014)出展のご案内
2014/09/02 【9/3(水) 開催】 JASISカンファレンス テクニカルセミナー講演のご案内
2014/07/16 【7/23(水)、31(木) 開催】 サーモフィッシャー機器分析ユーザーズフォーラム出展のご案内
2014/06/19 弊社プロダクト『Lipid Seach』を利用した論文が掲載されました。
脂質同定ソフトウェア『Lipid Search』(1.1MB)
※関連論文はこちらからご覧いただけます。
2014/05/07 バイオサイエンス室は愛宕オフィスに移転しました。 ※移転に伴い電話番号が変更しております。
地図はこちらからご覧いただけます。
2014/03/28 MKI、京都大学にがん治療研究に関する寄附講座を開設
2014/01/24 【2/13(木) 開催】 サーモフィッシャー『 リピドミクスセミナー 』講演のご案内
2013/11/07 【11/25(月) 開催】 第5回バイオサイエンスセミナー~ITが拓く未来-個別化医療へのアプローチ~ 開催のご案内
2013/10/15 【10/31(木) 開催】JSBi年会 ランチョンセミナー『次世代医療を支える大規模シーケンシングとインフォマティクス』のご案内
2013/09/03 【9/4(水) 開催】 JASISコンファレンス『健康計量ビジネスへの道』講演のご案内
2013/06/18 【7/2(火)大阪、7/3(水)東京開催】 サーモフィッシャー質量分析計ユーザーズフォーラム出展のご案内
2012/12/05 【1/17(木) 開催】 第4回三井情報バイオサイエンスセミナーのご案内~ITが拓く未来-視えてきたメタボロミクス~
2012/10/18 三井情報、大阪大学、サーモの共同研究がポスター賞を受賞しました。
SFC2012
大阪大学馬場先生HP
脂質同定ソフトウェア『Lipid Search』(1.1MB)PDF
2012/09/26 【プレスリリース】スパコン「京」による創薬プロジェクトに参画します。
2011/10/17 【11/28(月) 開催】 第3回三井情報バイオサイエンスセミナーのご案内~ITが拓く未来-先端バイオメディカル研究境界領域の役割とこれからの期待~
2011/06/30 【プレスリリース】メタボロミクス研究のための代謝経路解析システム「CrossPath」を販売開始しました。
2011/06/27 【7/5(金)、8(月) 開催】 サーモフィッシャー質量分析計ユーザーズフォーラム出展のご案内
2011/06/03 バイオサイエンス室は東中野オフィスに移転しました。
地図はこちらからご覧いただけます。
2011/05/27 「代謝経路解析システム」について掲載しました。
2011/04/15 ◆発表資料を公開しました◆
【2/18(金) 開催】 第2回三井情報バイオサイエンスセミナー
~ITが拓く未来-オミクス解析におけるインフォマティックスの活用~
2011/03/08 次世代シーケンス解析サービスのパンフレットを掲載しました。
2010/01/13 【2/18(木) 開催】 第2回三井情報バイオサイエンスセミナーのご案内
~ITが拓く未来-オミクス解析におけるインフォマティックスの活用~
2010/11/09 【12/1(水) 開催】 プロテイン・モール関西第7回情報交流セミナーのご案内
2010/07/16 【7/27(火) 開催】 日本ヒトプロテオーム機構 第8回大会 共催セミナーのご案内
「2DICAL が拓くプロテオームの新世界」
2010/05/14 2DICAL、Lipid Search、糖鎖微量迅速解析システム用検索ソフトのパンフレットを掲載しました。
2009/10/20 【11/26(木) 開催】 第1回三井情報バイオサイエンスセミナーのご案内
~ITが拓く未来-創薬を加速するインフォマティクス~
2009/06/29 【7/27(月)、28(火) 開催】 日本ヒトプロテオーム機構 第7回大会 出展のご案内
MKI三井情報は、創薬・診断研究を支援するプロテームプラットフォーム「Xome」「2DICAL」によるプロテオミクス解析ソリューションをご紹介いたします

 

取扱プロダクト

MKI三井情報では、バイオインフォマティクス関連のプロダクトをご紹介しております。掲載プロダクトにかかわらず、お客様に最適なプロダクトをご提案いたしますので、お困りの点、課題等がございましたら、フォームよりお気軽にお問い合わせください。

多検体サンプル解析&マーカー探索ソフト 2DICAL

ノンラベル液体クロマトグラフィー質量分析測定(LC/MS)に対応した多検体サンプル解析&マーカー探索ツールです。 LC/MS計測で得られるデータを 質量電荷比(m/z)、ピーク強度(I)、保持時間(RT)、サンプル(S) の4つの要素から成るものとしてとらえ、さまざまな2次元画像に展開して解析するシステムです。
2DICAL パンフレット

ハイスループット脂質同定システム Lipid Search

近年の質量分析技術の発展により生体分子の一斉同時解析が可能となり、 これに伴い生体分子の網羅的解析(オミックス)が脚光を浴びています。オミックスでは、その膨大な実験情報を効率的に処理するため、バイオインフォマティックスと呼ばれるコンピュータを用いた生体情報処理が必須の技術となっています。Lipid Searchは生体内脂質を対象としたハイスループットな網羅的解析(リピドミクス)を支援するソフトウェアとして東京大学大学院メタボローム寄付講座田口良教授と三井情報株式会社で共同開発したソフトウェアです。生体試料の質量分析データから含有する脂質の同定から定量計算までを全自動で解析致します。
Lipid Search パンフレット

メタボロミクス研究のための代謝経路解析システム CrossPath

薬効、安全性、バイオマーカー研究等で得られたメタボロミクスデータから動きのある代謝経路(パスウェイ)を自動選出し、変動した代謝物をパスウェイ上に視覚的にマッピングするソフトウェアです。
本製品により、膨大なメタボロミクスデータの生理学的な解釈が容易になり、病気の進行度や治療効果をモニタリングできるバイオマーカー開発や新薬開発研究の効率化が期待されます。

CrossPath パンフレット (1.1MB)

糖鎖微量迅速解析システム用検索ソフト

質量分析スペクトルと糖鎖質量分析スペクトルデータベースの照合を行い未知試料の糖鎖構造解析を行うソフトウェアです。
糖鎖微量迅速解析システム用検索ソフト パンフレット

※記載されている社名・商品名は、各社の商標または登録商標です。

Type CLOUD for AWS Bioinformatics

バイオインフォマティクス解析に特化した、専用解析サーバーを提供するクラウドサービスです。
AWSにかかる費用を固定にし、監視・運用・保守まですべてMKIにお任せいただくことが可能です。事前にお客様のご要望をお聞きした上で、MKIが提案するサービスメニュー(サーバ・監視運用その他サポート・オプション)を選択いただきます。
提供するインスタンスタイプやプリインストール済ソフトウェアは順次拡大予定です。

1)サービス仕様(リソース提供:サーバ)

提供サーバ
(Amazon EC2)
現在ご提供している代表的なインスタンスは以下です。
下記以外のインスタンスタイプもご用意しております。
・m4.large (2vCPU / 8GiB Memory / 100GB ストレージ)
・c4.2xlarge (8vCPU / 15GiB Memory / 100GB ストレージ)
・r3.4xlarge (16vCPU / 122GiB Memory / 100GB ストレージ)
OS Ubuntu Server 16.04 LTS
ソフトウェア
プリインストール済
以下のバイオインフォ解析パッケージをインストール済みでご提供
bedtools / blast2 / bowtie2 / bwa / clustalo / dssp / emboss / fastx-toolkit / 
gromacs / hmmer / mafft / ncbi-blast+ / picard-tools / pymol / qiime / rasmol /
samtools / t-coffee / TensorFlow 
パッケージ一覧はこちらをご参照ください。
Firewall セキュリティグループ設定を初期費用の範囲で対応
データ転送量 ・お客様拠点 → AWS は無料
・AWS → お客様拠点 は100GB/月まで無料(超過時は別途費用が発生致します)

 

2)サービス仕様(コンサルティング/解析作業役務提供/その他サポート) 

バイオインフォマティクス
解析パッケージの
技術サポートオプション
プリインストール済のバイオインフォ解析パッケージに関する技術的問題の解決支援、障害の受付、操作方法に関する質問に対して、サポートエンジニアが直接オンラインにて支援いたします。
価格:月額80,000円~(税抜)
カスタムメイド
インスタンスオプション/
HPCクラスタオプション
お客様の行いたい解析に最適な規模となる計算リソースサイズのコンサルティングを行い、GPGPUインスタンス等カスタムメイドのインスタンスやHPCクラスターをご提供します。
バイオインフォマティクス
解析コンサルティング
オプション
オンサイトまたはオフサイトで専任の担当者が、解析手法のコンサルティングから解析ツールの開発、実際の解析作業までの全工程をワンストップで担当いたします。

 

3) コンサルティング・解析オプション(詳細) 

抗体創薬支援 ヒト化抗体作成支援、パラトープ及びその周辺の残基同定など抗体創薬に関するコンサルティング、解析をご提供致します
詳細はこちら
各種データ解析 メチル化解析、発現量解析、マイクロアレイ解析、NGSデータ解析など各種バイオインフォマティクスデータ解析を担当し、ご希望の形式で解析結果レポートを作成致します
詳細はこちら
バイオ統合DB
アクセスサービス
近日公開予定
HPC-MD
環境構築支援
MD計算用の並列計算環境をReady to Useの状態でご提供致致します。
詳細はこちら

 

4)その他オプション 

通常オプション

  • Amazon S3ストレージ100GB追加(オンラインストレージサービス)
  • Amazon EBSストレージ100GB追加(仮想サーバHDD)
  • データ転送量100GB追加/月(AWSからのデータ送信量)
  • Amazon Route53(DNSサービス)
  • Amazon ELB(ロードバランサー)
  • Amazon VPC接続(仮想プライベートネットワーク環境)

取扱サービス

MKI三井情報では、バイオインフォマティクス関連のサービスをご提供しております。掲載サービスにかかわらず、お客様に最適なサービスをご提案いたしますので、お困りの点、課題等がございましたら、お気軽に右上のお問い合わせフォームにて、お問い合わせください。

次世代シーケンスデータ・マルチオミクス解析サービス

次世代シーケンスデータ・オミクス解析を検討中のお客様

大規模データから興味のある情報を取り出すまでには様々な悩みや問題が生じるかと思われます。
そのような場合はぜひ、弊社の
次世代シーケンスデータ・マルチオミクスデータ解析サービスをご活用ください。 

 

■次世代シーケンサー解析サービス例

  • 疾患原因遺伝子変異候補の探索や有用菌株の変異情報収集
  • 微生物の機能遺伝子候補の探索
  • 細菌群集の網羅的な組成解析
  • 環境変化に伴う遺伝子発現パターンの解析
  • 疾患関連遺伝子の発現制御の解析

■マルチオミクス解析サービスメニュー

  • マルチオミクスデータ解析サービス
  • マルチオミクス解析環境構築支援サービス

 

詳細は下記パンフレットをご確認下さい。
次世代シークエンスデータ・マルチオミクス解析サービス パンフレット

体細胞変異検出データ解析サービス

SureSelect NCC oncopanelをご利用の皆様に、データ解析サービスをお手頃な価格でご提供致します。
検出された変異情報に対して、さらに有用なデータベースからアノテーション情報を付加し、お客様に解析結果をお返しいたします。

■特徴

  • Agilent technologies 社のSureSelect NCC oncopanel に最適化
  • 新鮮凍結組織・ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織共に高い精度で変異を検出可能

■ご提供頂くデータについて

  • 腫瘍組織、正常組織から取得されたデータセット(FASTQ もしくは BAM 形式ファイル)

■価格

  • 価格:お問い合わせください
  • 納期:データ受領から最短3営業日

■納品物

  • SNV/InDel 解析結果
  • 融合遺伝子/コピー数変化解析結果

上記の条件以外のデータを用いて解析を依頼される場合は、別途お見積りの上でご対応申し上げます。
詳細は下記パンフレットをご確認下さい。

体細胞変異検出データ解析サービス パンフレット

HPC-MD環境構築支援サービス

大規模な科学計算を実施するのに必要なHPC(HighPerformanceComputing)環境を、お客様の課題に最適な形式・規模にて設計構築いたします。
また、構築したHPC環境や既存のコンピュータ・クラスタ環境にて分子動力学計算(MD:MolecularDynamics)等のシミュレーション計算環境を整備、シミュレーション計算を実施いたします。

■サービスメニュー

  • HPC環境構築支援サービス
  • 分子動力学計算環境構築支援サービス

詳細は下記パンフレットをご確認下さい。
HPC-MD環境構築支援サービス パンフレット

抗体創薬支援サービス

高精度な抗体構造モデリング技術、およびバイオインフォマティクスに基づく抗体医薬のRational Design、マウス抗体のヒト化設計を支援します。
弊社クラウド技術により秘匿性の高いお客様専用の解析環境を構築し、安全・ハイスピードなサービスを低コストで実現します。

■サービスメニュー

  • ・ヒト化抗体設計
  • ・抗体構造モデリングおよびバイオインフォマティクスによる抗体医薬のRational Design

ご要望に応じて、バイオインフォマティクス解析による親和性・物性向上設計についてもご相談承ります(別途お見積り)。
詳細は下記パンフレットをご確認下さい。

抗体創薬支援サービス パンフレット

バイオサイエンス事業の経緯

1975年にバイオサイエンスの研究開発に参画して以来30年以上に渡り、三井情報は先進的なIT技術をバイオサイエンスの研究に応用していく取組みを進めて参りました。 ポストゲノム時代を迎え、当社のバイオインフォマティクスに関する知識と経験は今後のバイオサイエンスの発展に大いに役立つものと確信しております。

三井情報は最先端の技術をお客様に提供し健康で持続可能な社会の発展に貢献します。

MKIの主な研究・受託開発案件 バイオサイエンス文化の出来事
シスメックスおよび理研ジェネシスとゲノム医療における包括的な業務提携 2017  
ライフデータ利活用環境等に関する調査 2016 オートファジーの仕組みの解明・大隅良典氏ノーベル生理学・医学賞受賞
大規模コホートメタボロミクスデータ解析 深層学習など人口知能(AI)に関する技術に注目が集まる
がんクリニカルシーケンスサービス「OncoPrime」開始 2015 日本医療研究開発機構(AMED)発足
バイオクラウドサービス開始 線虫感染症の新しい治療法の発見・大村智氏ノーベル生理学・医学賞受賞
抗体創薬支援サービス開始 DTC(Direct to Consumer)遺伝子検査サービス元年
HPC (High Performance Computing) 環境構築支援サービス開始
パスウェイ編集ソフトウェア「PathPod」の開発 2014 iPS細胞を用いた世界初の臨床手術成功(滲出型加齢黄斑変性)
STAP細胞論文不正問題
IBM Watson Genomics Analyticsをゲノム医療活用へ
Thermo Fisher Scientific社がハイスループット脂質同定システム「LipidSearch」の海外独占販売代理店となる 2013 遺伝子編集技術「CRISPR」
「京」によるスパコン創薬プロジェクト参画 ヒトのクローンES細胞作製
  2012 iPS細胞の開発・山中伸弥氏ノーベル生理学・医学賞受賞
低温電子顕微鏡法(クライオ電子顕微鏡法)の技術革新の加速
バイオプロセスデザインプラットフォームの構築 2011  
二次代謝産物の整合性遺伝子解析  
自社プロダクト販売開始

・ハイスループット脂質同定システム「LipidSearch」

・多検体サンプル解析&マーカー探索ソフト 「2DICAL」

・糖鎖微量迅速解析システム用検索ソフト

・メタボロミクス研究のための代謝経路解析システム「CrossPath」

2010  
製薬企業向け創薬探索支援開始
次世代シーケンスデータ解析サービス開始
マルチオミックスデータ解析サービス開始
多層的疾患オミックス解析統合データベースの構築
タンパク質の構造・機能・相互作用予測システムの開発と展開 2009 万能インフルエンザ治療薬へ向け、インフルエンザウィルスのRNAポリメラーゼ結晶構造解明(横浜市立大、筑波大)
マウス胚の画像データベース構築支援
国内基盤技術調査「睡眠障害に関する医療ニーズの調査」
薬剤候補物質の作用機序解析
将来動向調査「ウィルス感染症の将来動向」
国内基盤技術調査「性差医療に関する医療ニーズの調査」
生化学パスウェイ、転写制御ネットワークなどを マップとして公開し、ユーザがマップ上にコメントや キーワードなどのタグ付けを行うシステム「Payao」の開発 2008 ネアンデルタール人のミトコンドリアDNA、配列解析に成功
生命科学データベース横断検索システムの開発
統合遺伝子データベースの開発
薬学系統合検索システムの開発 2007 ヒトiPS細胞作製
CASP7参加要員
化合物等を活用した生物システム制御基盤技術開発プロジェクト(NEDO)
MRM定量システムの開発
プロテオーム解析プラットフォームの開発
脂質同定システム 「Lipid Search」の開発
ターゲットタンパク質実験マネージメントシステムの構築
GPCRリガンドデータベースの構築
遺伝子発現データクオリティコントロールシステムの開発
ミレニアムPJの日本人5疾患に関するNP、遺伝子発現、 、タンパク質2D-DIGEのデータを公開する 「疾患データベース(GeMDBJ)」の構築 2006 生殖細胞使わずに皮膚から万能細胞作製に成功(京大再生医科学研究所)
AffymetrixDNAチップ解析用データベースの開発
特許庁標準技術集「質量分析(マススペクトロメトリー)」作成
MRM定量システムで使用するペプチドを選び出すためのソフトウェアの開発
メタボローム解析用ソフトウェアの開発
電子顕微鏡実験データベースシステムの構築
作物土壌中の微生物叢の解析データベースの構築
作物土壌中の微生物叢のPCR-DGGE画像解析データベースの構築
遺伝子発現データマイニングシステムの開発
遺伝子発現データをクエリに公開データベース(GEO)を検索しネットワークを描かせるデータベースの開発
ゲノムネットワーク用統合XMLデータベースの構築
特許出願技術動向調査「バイオインフォマティクス」 2005 BSE感染牛を食べて「変異型クロイツフェルト・ヤコブ病」発症患者が国内初発生
シグナル伝達、代謝パスウェイ等のネットワークの描画、シミュレーションを行うSBMLモデルエディタ 「CellDesigner」の開発 次世代シーケンサー登場
 プロテオーム解析プラットフォーム「Xome」の開発  2003  稲の全遺伝情報の解読に成功(スイスの農業会社と米中の合同研究チーム)
質量分析法・田中耕一氏ノーベル化学賞受賞
 質量分析波形解析ソフトウェア「Mass Navigator」の開発 2002 ヒトゲノムシーケンスのドラフトを発表
 糖鎖構造データベースと解析ソフトウェアの研究開発(NEDO) 2001 シロイヌナズナのゲノムを完全解読(かずさDNA研究所ら)
 マイクロサテライトによる疾患感受性領域の同定支援   シロイヌナズナのゲノムを完全解読(かずさDNA研究所ら)     
 細胞内ネットワークのシミュレータ開発
 ゲノム上の全タンパク質の構造解析システムの開発
 cDNAの構造・機能予測システムの開発
 疾患SNPs検索、解析システムの開発/疾患関連遺伝子の多様性解析
 糖鎖合成関連遺伝子ライブラリーの構築のためのバイオインフォマティクス技術の研究開発(NEDO)
 遺伝子発現ネットワーク推定アルゴリズムとソフトウェアの研究開発(NEDO) 1999  ヒトの22番染色体を解読
 遺伝子発現プロファイル解析ツールの開発 1998 ヒトES細胞作製
遺伝子発現プロファイルデータベースの構築 1996 クローン羊ドリー出産(体細胞クローン技術の開発)
ゲノム物理地図作成ソフトウェアの開発 1995 ヒト遺伝子治療開始(NIH)
微生物の分類・同定手法の開発 Flavr Savr(遺伝子組換えトマト)市販
ND法に基づくゲノム塩基配列結合編集システムの開発 微生物ゲノム (Mycoplasma genitalium、Haemophilus influenzae) の全塩基配列決定
ヒトゲノム解析結果表示システムの開発  
ゲノムDNAの二次元電気泳動画像解析システム (DDGEL)の開発
 イスラエルCompugen社と提携
ゲノム解析支援システムDr.AGCTの開発
タンパク質立体構造アライメント表示システム (3DALIGN)の開発
遺伝子ネットワークの同定手法の開発
全ゲノム塩基配列決定支援システムの開発
発現プロファイル解析システムの開発
ドイツBIOBASE社と提携
  1994 高解像度のヒトゲノム物理的地図完成
タンパク質の機能部位予測システムの開発 1990 ヒトゲノム計画がスタート
GCG輸入開始
タンパク質立体構造エネルギー関数法の開発 1985 ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)発明(キャリー・マリス)
遺伝子の機能解析技術の開発
ショットガン法によるDNAフラグメントの結合編集システム
  1982 組換えインスリン認可
DNA構造解析システムの開発 1980  
DNAデータベースシステムの開発
  1977 DNA配列決定技術の確立(サンガー、マキサム、ギルバード)
ヒトソマトスタチン遺伝子を大腸菌で発現
  1975 ポリエチレングリコールによる細胞融合
モノクローナル抗体(ケーラー、ミルスタイン)
  1974 遺伝子組換え技術の確立(コーヘン、ボイヤー)
  1973 大腸菌へのDNA導入(マンデル、比嘉昭子)
  1970 制限酵素の発見
  1968 DNAリガーゼの発見
  1967 DNA合成酵素を発見(コーンバーグ)
  1956 センダイウイルスによる動物細胞融合(岡田善雄)
  1953 DNAの二重らせん構造解明(ワトソン、クリック)
  1951 インシュリンのアミノ酸配列の決定(サンガー)
  1945 ファージのDNA組換え(デルブリュック)
  1944  DNAによる肺炎双球菌形質転換(エイヴリー)

※記載されている社名・商品名は、各社の商標または登録商標です。

ゲノム・トランストリプトーム・プロテオーム

ゲノム

内容

キーワード

顧客

分野

2DICALを用いた多層的オミックス解析支援業務

ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、プロテオーム、メタボローム、医療

公的研究機関

医療

連鎖解析手法の調査及び解析デザインの構築

ゲノム、統計解析

公的研究機関

生命科学

次世代シーケンサ配列及び表現型情報統計処理システム構築業務

イネ、ゲノム

公的研究機関

農学

次世代シーケンサー向け最新データ解析環境の調査

ゲノム、統計解析

公的研究機関

生命科学

薬剤候補物質の作用機序解析

マイクロアレイ解析、プロモーター解析、プロテオーム解析

民間企業

薬学・創薬

マイクロサテライトによる疾患感受性領域の同定支援

疾患、マーカー探索

その他

バイオインフォマティクス

ミレニアムPJの日本人5疾患に関するSNP、遺伝子発現、タンパク質2D-DIGEのデータを公開する「疾患データベース(GeMDBJ)」の構築

疾患、SNP、マイクロアレイ、プロテオーム、画像、データベース

公的研究機関

医療

トランスクリプトーム

内容

キーワード

顧客

分野

次世代シーケンスデータ解析支援

次世代シーケンスデータ解析

公的研究機関

医療

網羅的メチル化データ解析支援

メチル化解析

公的研究機関

医療

2DICALを用いた多層的オミックス解析支援業務

ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、プロテオーム、メタボローム、医療

公的研究機関

医療

がん診断マーカー候補の探索支援

医療、がん、マーカー探索

公的研究機関

その他

遺伝子発現データ解析支援

マイクロアレイ解析

公的研究機関

医療

薬剤候補物質の作用機序解析

マイクロアレイ解析、プロモーター解析、プロテオーム解析

民間企業

薬学・創薬

発現データをクエリにGEO内の似たデータを検索しネットワークを描かせるデータベースの開発

マイクロアレイ、ネットワーク、データベース

公的研究機関

薬学・創薬

遺伝子発現データマイニング解析支援

マイクロアレイ解析、細胞表面糖鎖解析、メチル化解析

公的研究機関

医療

ミレニアムPJの日本人5疾患に関するSNP、遺伝子発現、タンパク質2D-DIGEのデータを公開する「疾患データベース(GeMDBJ)」の構築

疾患、SNP、マイクロアレイ、プロテオーム、画像、データベース

公的研究機関

医療

遺伝子発現プロファイル解析ツールの受託開発

マイクロアレイ、統計解析

その他

バイオインフォマティクス

遺伝子発現プロファイルデータベースの構築

マイクロアレイ、アノテーション、データベース

その他

バイオインフォマティクス

ゲノムネットワーク用統合XMLデータベースの構築

遺伝子転写ネットワーク、データベース

公的研究機関

生命科学

遺伝子発現ネットワーク推定アルゴリズムとソフトウェアの研究開発(NEDO)

遺伝子発現ネットワーク

官公庁

その他

作物土壌中の微生物叢のマイクロアレイ解析データベースの構築

微生物、マイクロアレイ、データベース

公的研究機関

農学

プロテオーム

内容

キーワード

顧客

分野

薬剤候補物質の作用機序解析

マイクロアレイ解析、プロモーター解析、プロテオーム解析

民間企業

薬学・創薬

2DICALを用いた多層的オミックス解析支援業務

ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、プロテオーム、メタボローム、医療

公的研究機関

医療

がん診断マーカー候補の探索支援

医療、がん、マーカー探索

公的研究機関

その他

BIRDタンパク質の構造・機能・相互作用予測システムの開発と展開

蛋白質立体構造解析

公的研究機関

生命科学

・CASP7参加要員

・NEDO化合物等を活用した生物システム制御基盤技術開発プロジェクト

蛋白質立体構造解析

公的研究機関

生命科学

ミレニアムPJの日本人5疾患に関するSNP、遺伝子発現、タンパク質2D-DIGEのデータを公開する「疾患データベース(GeMDBJ)」の構築

疾患、SNP、マイクロアレイ、プロテオーム、画像、データベース

公的研究機関

医療

MRM定量システムの受託開発

プロテオーム

公的研究機関

生命科学

MRM定量システムで使用するペプチドを選び出すためのソフトウェアの受託開発

プロテオーム

公的研究機関

生命科学

プロテオーム解析プラットフォーム「Xome」の受託開発

質量分析、プロテオーム

民間企業

薬学・創薬

波形解析ソフトウェア「Mass Navigator」の受託開発

質量分析、プロテオーム

民間企業

薬学・創薬

ターゲットタンパク質実験マネージメントシステムの構築

タンパク質、オントロジー、データベース

公的研究機関

生命科学

(特許庁)標準技術集「質量分析(マススペクトロメトリー)」作成

質量分析、プロテオーム

官公庁

その他

糖鎖・脂質・メタボローム・パスウェイ

糖鎖

内容

キーワード

顧客

分野

糖鎖構造データベースと解析ソフトウェアの研究開発(NEDO)

糖鎖、データベース

公的研究機関

生命科学

糖鎖合成関連遺伝子ライブラリーの構築のためのバイオインフォマティクス技術の研究開発(NEDO)

糖鎖、遺伝子

公的研究機関

生命科学

脂質・メタボローム

内容

キーワード

顧客

分野

2DICALを用いた多層的オミックス解析支援業務

ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、プロテオーム、メタボローム、医療

公的研究機関

医療

新規代謝経路マッピングツールの開発

メタボローム、タンパク質、パスウェイ

公的研究機関

工学

脂質同定システム 「Lipid Search」の受託開発

質量分析、脂質、メタボローム

公的研究機関

生命科学

パスウェイ

内容

キーワード

顧客

分野

新規代謝経路マッピングツールの開発

メタボローム、タンパク質、パスウェイ

公的研究機関

工学

発現データをクエリにGEO内の似たデータを検索しネットワークを描かせるデータベースの開発

マイクロアレイ、ネットワーク、データベース

公的研究機関

薬学・創薬

シグナル伝達、代謝パスウェイ等のネットワークの描画、シミュレーションを行うSBMLモデルエディタ「CellDesigner」の受託開発

システムバイオロジー

公的研究機関

生命科学

生化学パスウェイ、転写制御ネットワークなどをマップとして公開し、ユーザがマップ上にコメントやキーワードなどのタグ付けを行うシステム「Payao」の受託開発

パスウェイ、システムバイオロジー

公的研究機関

生命科学

ゲノムネットワーク用統合XMLデータベースの構築

遺伝子転写ネットワーク、データベース

公的研究機関

生命科学

遺伝子発現ネットワーク推定アルゴリズムとソフトウェアの研究開発(NEDO)

遺伝子発現ネットワーク

官公庁

その他

医療・薬学・創薬・その他

医療

内容

キーワード

顧客

分野

次世代シーケンスデータ解析支援

次世代シーケンスデータ解析

公的研究機関

医療

網羅的メチル化データ解析支援

メチル化解析

公的研究機関

医療

がん診断マーカー候補の探索支援

医療、がん、マーカー探索

公的研究機関

その他

遺伝子発現データ解析支援

マイクロアレイ解析

公的研究機関

医療

遺伝子発現データマイニング解析支援

マイクロアレイ解析、細胞表面糖鎖解析、メチル化解析

公的研究機関

医療

マイクロサテライトによる疾患感受性領域の同定支援

疾患、マーカー探索

その他

バイオインフォマティクス

ミレニアムPJの日本人5疾患に関するSNP、遺伝子発現、タンパク質2D-DIGEのデータを公開する「疾患データベース(GeMDBJ)」の構築

疾患、SNP、マイクロアレイ、プロテオーム、画像、データベース

公的研究機関

医療

薬学・創薬

内容

キーワード

顧客

分野

2DICALを用いた多層的オミックス解析支援業務

ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、プロテオーム、メタボローム、医療

公的研究機関

医療

新規代謝経路マッピングツールの開発

メタボローム、タンパク質、パスウェイ

公的研究機関

工学

将来動向調査「慢性疼痛の将来動向」

薬学・創薬

公的研究機関

薬学・創薬

国内基盤技術調査「2020年の医療ニーズの展望」

薬学・創薬

公的研究機関

薬学・創薬

薬剤候補物質の作用機序解析

マイクロアレイ解析、プロモーター解析、プロテオーム解析

民間企業

薬学・創薬

発現データをクエリにGEO内の似たデータを検索しネットワークを描かせるデータベースの開発

マイクロアレイ、ネットワーク、データベース

公的研究機関

薬学・創薬

・CASP7参加要員

・NEDO化合物等を活用した生物システム制御基盤技術開発プロジェクト

蛋白質立体構造解析

公的研究機関

生命科学

GPCRリガンドデータベースの構築

リガンド、データベース

公的研究機関

薬学・創薬

プロテオーム解析プラットフォーム「Xome」の受託開発

質量分析、プロテオーム

民間企業

薬学・創薬

波形解析ソフトウェア「Mass Navigator」の受託開発

質量分析、プロテオーム

民間企業

薬学・創薬

薬学系統合検索システムの受託開発

薬学・創薬、検索システム

公的研究機関

薬学・創薬

国内基盤技術調査「睡眠障害に関する医療ニーズの調査」

薬学・創薬

公的研究機関

薬学・創薬

将来動向調査「ウィルス感染症の将来動向」

薬学・創薬

公的研究機関

薬学・創薬

国内基盤技術調査「性差医療に関する医療ニーズの調査」

薬学・創薬

公的研究機関

薬学・創薬

 

その他

内容

キーワード

顧客

分野

2DICALを用いた多層的オミックス解析支援業務

ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、プロテオーム、メタボローム、医療

公的研究機関

医療

海洋生物サンプルデータベース構築

海洋生物、画像、データベース

公的研究機関

その他

マウス胚の画像データベース構築支援

発生、画像、データベース

公的研究機関

医療

ミレニアムPJの日本人5疾患に関するSNP、遺伝子発現、タンパク質2D-DIGEのデータを公開する「疾患データベース(GeMDBJ)」の構築

疾患、SNP、マイクロアレイ、プロテオーム、画像、データベース

公的研究機関

医療

生命科学データベース横断検索システムの受託開発

生命情報全般、検索システム、データベース

公的研究機関

バイオインフォマティクス

薬学系統合検索システムの受託開発

薬学・創薬、検索システム

公的研究機関

薬学・創薬

電子顕微鏡実験データベースシステムの構築

顕微鏡、画像、データベース

公的研究機関

生命科学

作物土壌中の微生物叢のPCR-DGGE画像解析データベースの構築

微生物、画像、データベース

公的研究機関

農学

特許出願技術動向調査「バイオインフォマティクス」

特許、バイオインフォマティクス

官公庁

その他

※記載されている社名・商品名は、各社の商標または登録商標です。

投稿論文(技術提供含む)

著書

※記載されている社名・商品名は、各社の商標または登録商標です。

お問い合わせ

担当部門:バイオサイエンス室 電話番号:03-6376-1291